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- 第一节 枝木蕨目 Cladoxylales
- 灯笼蕨属 Denglongia Xue et Hao,2008
- 异枝蕨属 Metacladophyton Wang and Geng,1997
- 多枝蕨属 Ramophyton Wang,2008
- 第二节 莲座蕨目 Marattiales
- 一、莲座蕨科 Angiopteridaceae
- 二、星囊蕨科 Asterothecaceae
- 三、 合囊蕨科 Marattiaceae
- 第三节 真蕨目 Filicales
- 一、紫萁科 Osmundaceae
- 二、海金沙科 Schizaeaceae
- 三、里白科 Gleicheniaceae
- 四、马通蕨科 Matoniaceae
- 五、 蚌壳蕨科 Dicksoniaceae
- 六、 桫椤科 Cyatheaceae
- 七、 双扇蕨科 Dipteridaceae
- 八、 水龙骨科 Polypodiaceae
- 九、 膜蕨科 Hymenophyllaceae
- 十、 铁线蕨科 Adiantaceae
- 十一、蹄盖蕨科 Athyriaceae
- 十二、铁角蕨科 Aspleniaceae
- 十三、鳞毛蕨科 Dryopteridaceae
- 十四、凤尾蕨科 Pteridaceae
- 十五、蝶形蕨科 Weichseliaceae
- 第四节 槐叶萍目 Salviniales
- 槐叶萍科 Salviniaceae
- 槐叶萍属 Salvinia Adans,1763
