第四章马氏链与基因组

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马尔可夫过程及其应用：算法，网络，基因与金融作者：Étienne Pardoux 著，许明宇译　　 ISBN：978-7-04-051380-6　出版时间：2019-03-21

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前辅文

第一章蒙特卡罗方法与模拟

第二章马氏链

第三章随机算法

第四章马氏链与基因组

第五章马氏链的控制和滤波

第六章泊松过程

第七章带跳马尔可夫过程

第八章排队与网络

第九章金融数学引论

第十章部分习题解答

参考文献

索引
- 4.1 如何解读 DNA?
- 4.1.1 Cp G 岛
- 4.1.2 在原核基因组中探测基因
- 4.2 独立同分布序列模型
- 4.3 马尔可夫模型
- 4.3.1 在 Cp G 岛中的应用
- 4.3.2 在原核生物的整组基因中寻找基因
- 4.3.3 马氏链 {Mk 的统计
- 4.3.4 分段马氏链
- 4.3.5 局部齐次马氏链
- 4.4 隐马氏链
- 4.4.1 似然估计的计算
- 4.4.2 Viterbi 算法
- 4.4.3 参数估计
- 4.5 隐半马尔可夫模型
- 4.5.1 隐马尔可夫模型的局限
- 4.5.2 什么是半马氏链?
- 4.5.3 隐半马尔可夫模型
- 4.5.4 半马氏链的 Viterbi 算法
- 4.5.5 在原核生物基因组中寻找基因
- 4.6 对齐两个序列
- 4.6.1 Needleman--Wunsch 算法
- 4.6.2 隐马氏链比对算法
- 4.6.3 对齐序列的后验概率分布
- 4.6.4 一个配对的后验概率
- 4.7 一个多重比对算法
- 4.8 习题

第四章马氏链与基因组

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